深中南山创新学校原校名为深圳市南山区留仙学校，由深圳市南山文理实验学校校长兼党支部书记吴希福同志负责筹办，刘玉兵、张志林、章昱为筹办组成员。
留仙学校于2017年秋季开学，共开设6个年级，23个教学班，学生733人，专任教师56人。
留仙学校发展定位为创办一所“高质量、综合性、经典型”的九年一贯制公办学校。突出“国际化、信息化、人文化、生态化”的办学特色，把学生培养成全面发展的思考者、学习者和沟通者。
作为南山区政府和区教育局在西丽片区重点打造的一所全新优质品牌学校，留仙学校备受社会关注。深圳市委常委、常务副市长刘庆生同志，南山区委书记王强同志，南山区政协主席陈军同志，南山区人大副主任曾令格同志，南山区人民政府副区长练聪同志，南山区政协副主席、教育局局长刘根平同志，南山区委教育工委书记马颖丽同志等先后到留仙学校视察调研。
2018年5月25日，深圳中学与南山区人民政府和大疆公益基金会举行合作办学签约揭牌仪式，留仙学校更名为深中南山创新学校，并由深圳中学负责管理。
