深中南山创新学校图书馆位于学校西侧教学楼，馆舍总面积731.3平方米,馆内布置温馨舒适，功能分区明确。系藏、借、阅三位一体、服务全校师生的综合性图书馆。
步入图书馆的大门，在服务台的两侧分别设置了接待区和导览区，图书馆的服务功能和数字化资源一览无余。图书、期刊、报纸等各类资源齐全，根据学生的年龄特点分设低年级阅读区，中高年级阅览区和电子览区。各式休闲座椅为师生的个性化阅读提供了便利。
目前馆藏纸质图书78839册，17169种藏书，种类包括哲学、科学、教育、文学、历史、地理、艺术、综合等22个大类。初中生均图书42册/人，小学生均图书34册/人。订阅纸质期刊80种、报纸30余种。《中文在线》数字图书馆资源实现馆内全覆盖包括图书五万册,期刊3千种、听书资源3万集。
