自建校以来，学校一直致力于教育改革和创新人才培养的探索工作，注重以“创新引领未来”为办学理念，以培养具有中国根基，兼具国际视野的创新人才为育人目标，制定并实施深中创新课程体系。
课程总体思路：全面落实国家课程，努力保证个性需求，突出体现科技特色，培育以“5C”为核心目标的创新人才。
课程设置原则：
以人为本、关注需求，教师按需开课，学生按需选学。
深中创新课程图谱
一个愿景：
通过丰富机动的课程内容及灵活多样的教学方法，实现学生发展自由有序，教师成长内外兼修，建设开放的未来学习中心。
四个原则：
不搞齐步走，少做大一统；
课程多样化，发展差异化；
教师按需开课，学生按需选学；
让学生更有价值地学习，更主动地学习，更高效地学习。
四种方式：
选修与免修相结合，校内与校外相结合
自修与合作相结合，线上与线下相结合
八项策略：
支持个别学生跨年级学习。未来的教育是极具个性化的行为，人的基础素养、认知水平及学习程度各有差异，学校将制定有关条例，帮助部分学有所长的学生对标适合自己的年级和班级，进行跨级学习。
实行部分年级部分科目分层教学。针对大部分学生的学习特点及能力基础，学校尝试在四至九年级实行分层教学，力求符合大部分学生最近发展区，从而提高教学的针对性和有效性。
允许个别学生免修、选修、跳级。对于极少数学有余力的学生，学校制定免修、选修、跳级方案，鼓励学生释放精力，开发优势智能或补齐个人短板。
鼓励师生共同开发、自主选择课程。教师和学生都是课程的开发者和实施人，在试试和评估的过程中，学生能力得到了发展，教师的职业生涯也更丰富多彩。
普及人工智能进课堂。整合信息、科学教研组，建设创客体验中心、泛在学习中心、无土栽培实验室、机器人实验室、大疆无人机实验室等多个科技创新类实验室；建立生态体验中心、多功能智能教室、艺术创新中心等未来教室供学生们使用。
开展混龄教学，以不同年龄层的学生共同学习，培养学生自主、合作、探究、沟通的能力。
强调教师自我补给、提升。学校按教师的学识、个性特长，组织多个教师学习共同体，有效研讨，取长补短，促进教师的自我提升。
开设创新课程，努力实现每个学生一张课表。以“项目式教学”和“综合课堂”为突破口，引导学生实现深度学习，无边界学习，完善学习支撑体系，深入推进创新教育的发展。
